La saison 5 de la série X-files comprends seulement 20 épisodes.
Episode 1 : Bandits solitaires (Unusual suspects)
Episode 2 : Le complot (Redux 1/2)
Episode 3 : La voix de la vérité (Redux 2/2)
Episode 4 : Détour (Detour)
Episode 5 : Emily 1/2 (Christmas Carol)
Episode 6 : Prométhée post-moderne (Post-modern prometheus)
Episode 7 : Emily 2/2 (Emily)
Episode 8 : Kitzunegari (Kitsunegari)
Episode 9 : Schizogonie (Schizogeny)
Episode 10 : La poupée (Chinga)
Episode 11 : Clic mortel (Kill switch)
Episode 12 : Le shérif a les dents longues (Bad blood)
Episode 13 : Patient X 1/2 (Patient X)
Episode 14 : Patient X 2/2 (The red and the black) :
Episode 15 : Compagnons de route (Travelers)
Episode 16 : L’oeil de l’esprit (Mind’s eye)
Episode 17 : L’oeil de l’esprit (Mind’s eye)
Episode 18 : Les nouveaux spartiates (The pine bluff variant)
Episode 19 : Folie à deux (Folie à deux)
Episode 20 : La fin (The end)